Stagiaire en sauvetage de données : Rolando Trejo-Pérez, Institut de recherche en biologie végétale (IRBV), Université de Montréal Durant l’été 2023, j’ai participé à un stage de sauvetage de données dans le cadre du Certificat en gestion des données et recherche reproductible. L’objectif principal de ce stage était de nettoyer et de transférer sur DataStream les données sur la qualité et la température de l’eau fournies par la Nova Scotia Salmon Association (NSSA). Cette transformation et ce nettoyage ont été réalisés à l’aide de scripts R reproductibles, garantissant la cohérence et la transparence du processus de conversion des données. Figure 1. Carte des sites inclus dans A) le projet W.A.T.E.R. (Watershed Assessments Towards Ecosystem Recovery), B) le projet WRSH (West River, Sheet Harbour) Acid, et C) le projet Oceans North. Sources : Dépliant/Vignettes © Esri-Source : Esri, i-cubed, USDA, USGS, AEX, GeoEye, Getmapping, Aerogrid, IGN, IGP, UPR-EGP, UPR-EGP et communauté d’utilisateurs SIG.
La Nova Scotia Salmon Association (NSSA) est un organisme de conservation caritatif axé sur la gestion judicieuse et la préservation des stocks sauvages de saumons et de truites de l’Atlantique. Elle a mis en œuvre des programmes axés sur les solutions pour résoudre des problèmes à l’échelle provinciale notamment, depuis 17 ans, le programme d’atténuation des précipitations acides dans la rivière West de la région de Sheet Harbour ; ainsi que la lutte à la perte et à la dégradation de l’habitat grâce au programme Adopt-a-Stream. Dans ce cadre, la NSSA a rassemblé d’importantes données sur la qualité et la température de l’eau et souhaite les rendre facilement accessibles au public. Une manière d’y arriver consiste à archiver les données sur le portail DataStream, une organisation caritative dédiée à aider les groupes de surveillance de l’eau à partager des données à l’échelle régionale, en utilisant des standards cohérents et rigoureux qui favorisent la réutilisation des données. Les ensembles de données liées à trois projets de la NSSA devaient être archivés dans le cadre de l’Atlantic DataStream Initiative : 1. Le projet Southern Upland W.A.T.E.R : données collectées entre 2020 et 2022 dans le cadre du projet W.A.T.E.R. (Watershed Assessments Towards Ecosystem Recovery) pour les espèces aquatiques en péril sous la forme d’étude de la qualité et de la température de l’eau dans 121 sites répartis dans 8 bassins versants prioritaires des hautes terres du sud, ainsi que d’autres ensembles de données plus petits provenant d’autres bassins versants de la province. 2. Le projet Oceans North : données recueillies en 2019 pour mieux comprendre la répartition actuelle du saumon atlantique et caractériser la qualité de l’habitat le long de la côte est de la Nouvelle-Écosse. 3. Le projet Pluies acides WRSH : données collectées entre 2003 et 2020 pour évaluer l’efficacité des techniques de chaulage, y compris l’utilisation de deux doseurs ainsi que le chaulage aérien, pour atténuer les effets hérités des pluies acides dans la rivière West, dans la région de Sheet Harbour. Au cours de mon stage, j’ai réalisé l’archivage de deux jeux de données dans le portail DataStream, les données provenant du projet Southern Upland W.A.T.E.R et du projet Oceans North. Ces ensembles de données sont actuellement sous embargo et seront accessibles en septembre 2024 sur https://atlanticdatastream.ca/fr/. De plus, j’ai prétraité les données du projet WRSH Acid Rain pour les préparer à leur transfert dans DataStream. Tout au long de ce stage, j’ai mis à profit mes compétences en langage de programmation R pour créer des fichiers .csv pour chaque projet. Ces fichiers .csv contiennent toutes les données transformées et nettoyées essentielles non seulement à la visualisation des données dans DataStream, mais également au téléchargement public, pour toute personne souhaitant mettre à profit ces précieuses données canadiennes. Ce Projet Living Data a été réalisé en partenariat avec la Nova Scotia Salmon Association (NSSA) et l’initiative DataStream de la Gordon Foundation. J’aimerais remercier chaleureusement Amy Weston, Edmund A. Halfyard, Aislin Livingston, Meghan McLeod et Mike Lavender pour leur soutien inestimable pendant mon stage d’été. J’ai hâte de voir ces données rendues publiques dans les mois à venir !
0 Comments
Leave a Reply. |
Archives
October 2024
CatÉgories |